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RNA-seq實驗原理及過程:
轉錄組是某個物種或者特定細胞類型產生的所有轉錄本的集合。轉錄組研究能夠從整體水平研究基因功能以及基因結構,揭示特定生物學過程以及**發(fā)生過程中的分子機理。
先將樣品提取總RNA,在這之后,除去rRNA(對于真核生物,用帶有Oligo(dT)的磁珠富集mRNA,對于原核生物,用試劑盒去除rRNA),向得到的mRNA中加入Fragmentation Buffer使其片斷成為短片段,再以片斷后的mRNA為模板,用六堿基隨機引物(random hexamers)合成cDNA**鏈,并加入緩沖液、dNTPs、RNase H 和DNA polymerase I 合成cDNA第二鏈,經過QiaQuick PCR試劑盒純化并加 EB緩沖液洗脫經末端修復、加堿基A,加測序接頭,再經瓊脂糖凝膠電泳回收目的大小片段,并進行PCR擴增,從而完成整個文庫制備工作,構建好的文庫用Illumina HiSeq2000進行測序。
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